Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TAF1BQ53T94 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF1BQ53T94 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TAF1BQ53T94 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF1BQ53T94 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF1BQ53T94 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms