Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALFQ53S48 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALFQ53S48 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms