Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP55Q53EZ4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP55Q53EZ4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms