Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PABPC1LQ4VXU2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PABPC1LQ4VXU2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms