Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPN20Q4JDL3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN20Q4JDL3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms