Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DUSP28Q4G0W2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUSP28Q4G0W2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUSP28Q4G0W2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms