Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC153Q494R4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC153Q494R4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms