Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP41Q3LFD5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP41Q3LFD5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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