Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KNOP1Q1ED39 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KNOP1Q1ED39 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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