Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IMPG1Q17R60 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IMPG1Q17R60 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms