Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCK2Q16822 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCK2Q16822 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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