Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
FOXD1Q16676 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FOXD1Q16676 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD1Q16676 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
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