Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDK4Q16654 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDK4Q16654 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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