Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CTF1Q16619 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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CTF1Q16619 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CTF1Q16619 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CTF1Q16619 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CTF1Q16619 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CTF1Q16619 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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CTF1Q16619 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTF1Q16619 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTF1Q16619 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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