Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TAF9Q16594 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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TAF9Q16594 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TAF9Q16594 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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