Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRNP35Q16560 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
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