Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKN1Q16512 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKN1Q16512 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKN1Q16512 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PKN1Q16512 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PKN1Q16512 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PKN1Q16512 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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