Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA4Q16363 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LAMA4Q16363 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
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