Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTRK3Q16288 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NTRK3Q16288 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTRK3Q16288 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
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