Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGN3Q15651 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGN3Q15651 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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