Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX2Q14781 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms