Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMC1AQ14683 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMC1AQ14683 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
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