Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SQLEQ14534 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SQLEQ14534 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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