Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ERV3-1Q14264 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERV3-1Q14264 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms