Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SMAD4Q13485 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD4Q13485 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD4Q13485 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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