Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB3BPQ13352 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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