Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATMQ13315 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATMQ13315 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATMQ13315 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATMQ13315 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ATMQ13315 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATMQ13315 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATMQ13315 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATMQ13315 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATMQ13315 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATMQ13315 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATMQ13315 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATMQ13315 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATMQ13315 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATMQ13315 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATMQ13315 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATMQ13315 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATMQ13315 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATMQ13315 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATMQ13315 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATMQ13315 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATMQ13315 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATMQ13315 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATMQ13315 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATMQ13315 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATMQ13315 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATMQ13315 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATMQ13315 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATMQ13315 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATMQ13315 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATMQ13315 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATMQ13315 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATMQ13315 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATMQ13315 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATMQ13315 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATMQ13315 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATMQ13315 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATMQ13315 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATMQ13315 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATMQ13315 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATMQ13315 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATMQ13315 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATMQ13315 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATMQ13315 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ATMQ13315 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATMQ13315 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATMQ13315 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATMQ13315 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATMQ13315 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATMQ13315 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATMQ13315 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATMQ13315 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATMQ13315 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATMQ13315 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATMQ13315 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATMQ13315 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATMQ13315 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATMQ13315 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATMQ13315 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATMQ13315 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATMQ13315 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATMQ13315 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATMQ13315 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATMQ13315 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATMQ13315 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATMQ13315 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATMQ13315 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATMQ13315 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATMQ13315 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATMQ13315 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATMQ13315 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATMQ13315 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATMQ13315 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATMQ13315 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ATMQ13315 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATMQ13315 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATMQ13315 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATMQ13315 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATMQ13315 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATMQ13315 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATMQ13315 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATMQ13315 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms