Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHAF1AQ13111 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHAF1AQ13111 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHAF1AQ13111 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
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