Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRN3Q13033 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STRN3Q13033 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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