Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NPRL3Q12980 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NPRL3Q12980 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms