Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFEMP1Q12805 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EFEMP1Q12805 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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