Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNMA1Q12791 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNMA1Q12791 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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