Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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GTF3C1Q12789 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF3C1Q12789 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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GTF3C1Q12789 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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GTF3C1Q12789 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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GTF3C1Q12789 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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GTF3C1Q12789 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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GTF3C1Q12789 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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GTF3C1Q12789 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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GTF3C1Q12789 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF3C1Q12789 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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