Protein–RNA interactions for Protein: Q12211

PUS1, tRNA pseudouridine synthase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS1Q12211 YJR061WYJR061W 2808 nt5.67□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 MAD3YJL013C 1548 nt5.67□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 APM2YHL019C 1818 nt5.67□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 THP1YOL072W 1368 nt5.67□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 PAL1YDR348C 1500 nt5.66□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 YDR199WYDR199W 366 nt5.66□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 YDR535CYDR535C 501 nt5.66□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 YER158W-AYER158W-A 216 nt5.66□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 YFR035CYFR035C 345 nt5.66□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 CDC43YGL155W 1131 nt5.66□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 FMP48YGR052W 1110 nt5.66□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt5.66□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 YMR084WYMR084W 789 nt5.66□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 YBL094CYBL094C 333 nt5.66□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 YOR314WYOR314W 330 nt5.66□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 FAA3YIL009W 2085 nt5.66□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 PGS1YCL004W 1566 nt5.66□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 MSC7YHR039C 1935 nt5.66□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 HXT7YDR342C 1713 nt5.65□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 HXT6YDR343C 1713 nt5.65□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 HRR25YPL204W 1485 nt5.65□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 DAK1YML070W 1755 nt5.65□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 RRP3YHR065C 1506 nt5.65□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 APN2YBL019W 1563 nt5.65□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 MHF2YDL160C-A 243 nt5.65□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 YER034WYER034W 558 nt5.65□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 SCS2YER120W 735 nt5.65□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 BUD13YGL174W 801 nt5.65□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 AHP1YLR109W 531 nt5.65□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 ATG8YBL078C 354 nt5.65□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 snR10snR10 245 nt5.65□□□□□ -1.5
PUS1Q12211 ZRC1YMR243C 1329 nt5.65□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 TFG1YGR186W 2208 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 SEG2YKL105C 3399 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 HAP1YLR256W 4509 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 ACF2YLR144C 2340 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 STE12YHR084W 2067 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 MRE11YMR224C 2079 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 SSE2YBR169C 2082 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 THI21YPL258C 1656 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 snR65snR65 100 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 CNL1YDR357C 369 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 PUG1YER185W 912 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 COS4YFL062W 1140 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 PRP18YGR006W 756 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 ECT1YGR007W 972 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 CFD1YIL003W 882 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 RRT16YNL105W 429 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 MCK1YNL307C 1128 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 SOL1YNR034W 966 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 TSR4YOL022C 1227 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 ZUO1YGR285C 1302 nt5.64□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YCR064CYCR064C 411 nt5.63□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 RRP45YDR280W 918 nt5.63□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 NKP1YDR383C 717 nt5.63□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 RGI1YER067W 486 nt5.63□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YER134CYER134C 537 nt5.63□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 VMA21YGR105W 234 nt5.63□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 ATG27YJL178C 816 nt5.63□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YBL044WYBL044W 369 nt5.63□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 GIM3YNL153C 390 nt5.63□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt5.63□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 snR41snR41 95 nt5.63□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt5.63□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 AEP1YMR064W 1557 nt5.63□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 UBP7YIL156W 3216 nt5.63□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 AIM10YER087W 1731 nt5.62□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 TMA20YER007C-A 546 nt5.62□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 UBX4YMR067C 1251 nt5.62□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt5.62□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YRB30YGL164C 1323 nt5.62□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt5.62□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YFL040WYFL040W 1623 nt5.62□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 BOP2YLR267W 1713 nt5.62□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YAP1YML007W 1953 nt5.62□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 TOS3YGL179C 1683 nt5.61□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.61□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YJR037WYJR037W 384 nt5.61□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 PRP45YAL032C 1140 nt5.61□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 BLI1YKL061W 342 nt5.61□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.61□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 IMP2YMR035W 534 nt5.61□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 GCY1YOR120W 939 nt5.61□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 RPA43YOR340C 981 nt5.61□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 TCM62YBR044C 1719 nt5.61□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 DSS4YPR017C 432 nt5.61□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 FZO1YBR179C 2568 nt5.61□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 TPS3YMR261C 3165 nt5.6□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 MET3YJR010W 1536 nt5.6□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 MCH4YOL119C 1506 nt5.6□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 COX13YGL191W 390 nt5.6□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YGR160WYGR160W 612 nt5.6□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 HIT1YJR055W 495 nt5.6□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YJR087WYJR087W 351 nt5.6□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 ARC18YLR370C 537 nt5.6□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YMR099CYMR099C 894 nt5.6□□□□□ -1.51
PUS1Q12211 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt5.6□□□□□ -1.51
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