Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	MAL32	YBR299W	1755 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	TOP1	YOL006C	2310 nt		3.3	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	IOC3	YFR013W	2364 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	PET54	YGR222W	882 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	YBL065W	YBL065W	345 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	YOR020W-A	YOR020W-A	273 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	YOR186W	YOR186W	435 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	GPI2	YPL076W	843 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	SNT1	YCR033W	3681 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	GAT2	YMR136W	1683 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	YMR1	YJR110W	2067 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	SSE2	YBR169C	2082 nt		3.29	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	VPS33	YLR396C	2076 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	UBC8	YEL012W	657 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	YPT35	YHR105W	645 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	ERP1	YAR002C-A	660 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	TAF14	YPL129W	735 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	MAK21	YDR060W	3078 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	YDL180W	YDL180W	1644 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	ULP1	YPL020C	1866 nt		3.28	□□□□□ -1.88
VIK1	Q12045	CAF130	YGR134W	3369 nt		3.28	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	IMH1	YLR309C	2736 nt		3.28	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	LTV1	YKL143W	1392 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	SCM4	YGR049W	564 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	LST7	YGR057C	729 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	YIL025C	YIL025C	375 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	ATP12	YJL180C	978 nt		3.27	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	MSA1	YOR066W	1890 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	GTF1	YGR102C	552 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	FMC1	YIL098C	468 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	YVH1	YIR026C	1095 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	REE1	YJL217W	597 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	YUH1	YJR099W	711 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	COQ9	YLR201C	783 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	YNL144W-A	YNL144W-A	84 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	NDJ1	YOL104C	1059 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	ARO1	YDR127W	4767 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	NUP60	YAR002W	1620 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	FAR1	YJL157C	2493 nt		3.26	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	DRS2	YAL026C	4068 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	RSC1	YGR056W	2787 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	YDR161W	YDR161W	1164 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	RPL30	YGL030W	318 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	MRPL6	YHR147C	645 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	ARC15	YIL062C	465 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	RET3	YPL010W	570 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	RPA135	YPR010C	3612 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	FRE4	YNR060W	2160 nt		3.25	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	MGR3	YMR115W	1506 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	LCB4	YOR171C	1875 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	VTC4	YJL012C	2166 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	ARP4	YJL081C	1470 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	RPC11	YDR045C	333 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	TFA2	YKR062W	987 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	DGA1	YOR245C	1257 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	OPY1	YBR129C	987 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	CTK1	YKL139W	1587 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	CPA2	YJR109C	3357 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	BCS1	YDR375C	1371 nt		3.24	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	YCR007C	YCR007C	720 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	RCR2	YDR003W	633 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	LIF1	YGL090W	1266 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	ADH4	YGL256W	1149 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	YGR161W-C	YGR161W-C	279 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	RPC17	YJL011C	486 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	YLR154C-H	YLR154C-H	132 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	YLR156C-A	YLR156C-A	132 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	YLR157C-C	YLR157C-C	132 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	YLR159C-A	YLR159C-A	132 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	MCM1	YMR043W	861 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	YMR141C	YMR141C	309 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	PNT1	YOR266W	1272 nt		3.23	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	MIC60	YKR016W	1623 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	BCH1	YMR237W	2175 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	UTP6	YDR449C	1323 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	PRM15	YMR278W	1869 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	YDL026W	YDL026W	312 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	IES6	YEL044W	501 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	ERV29	YGR284C	933 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	YAL069W	YAL069W	315 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	TPM1	YNL079C	600 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	RAD2	YGR258C	3096 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	PRS5	YOL061W	1491 nt		3.22	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	SUP45	YBR143C	1314 nt		3.21	□□□□□ -1.89
VIK1	Q12045	EPO1	YMR124W	2832 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	EMP70	YLR083C	2004 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	MIG1	YGL035C	1515 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	SHU2	YDR078C	672 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	MRPS35	YGR165W	1038 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	RPS21B	YJL136C	264 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	IAH1	YOR126C	717 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	UAF30	YOR295W	687 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	MCM16	YPR046W	546 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	ATG26	YLR189C	3597 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	SSL1	YLR005W	1386 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YBR238C	YBR238C	2196 nt		3.21	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	CCM1	YGR150C	2595 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YDR089W	YDR089W	2610 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	SPO71	YDR104C	3738 nt		3.2	□□□□□ -1.9
VIK1	Q12045	YCL076W	YCL076W	744 nt		3.2	□□□□□ -1.9

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