Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBRQ0VD83 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBRQ0VD83 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms