Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RASGEF1BQ0VAM2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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