Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C2orf54Q08AI8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2orf54Q08AI8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms