Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DHX9Q08211 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX9Q08211 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms