Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP4Q07065 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CKAP4Q07065 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 657.5 ms