Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	YGL074C	YGL074C	327 nt		4.03	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	DCG1	YIR030C	735 nt		4.03	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	NIS1	YNL078W	1224 nt		4.03	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	RFC3	YNL290W	1023 nt		4.03	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	IZH4	YOL101C	939 nt		4.03	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	YBL107W-A	YBL107W-A	105 nt		4.03	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	TMC1	YOR052C	453 nt		4.03	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	TFB6	YOR352W	1032 nt		4.03	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	LDH1	YBR204C	1128 nt		4.03	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	GEM1	YAL048C	1989 nt		4.03	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	BUD27	YFL023W	2391 nt		4.03	□□□□□ -1.76
MRD1	Q06106	YPR022C	YPR022C	3402 nt		4.02	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	DSL1	YNL258C	2265 nt		4.02	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	GCN5	YGR252W	1320 nt		4.02	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	PEP7	YDR323C	1548 nt		4.02	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YDR124W	YDR124W	975 nt		4.02	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	RRP17	YDR412W	708 nt		4.02	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	BMH1	YER177W	804 nt		4.02	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YIL102C-A	YIL102C-A	228 nt		4.02	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	IDP2	YLR174W	1239 nt		4.02	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YML090W	YML090W	387 nt		4.02	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	IMP4	YNL075W	873 nt		4.02	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	ATG19	YOL082W	1248 nt		4.02	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	MEK1	YOR351C	1494 nt		4.02	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	DSS1	YMR287C	2910 nt		4.02	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	PCL7	YIL050W	858 nt		4.01	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	AIR1	YIL079C	1083 nt		4.01	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	GTT1	YIR038C	705 nt		4.01	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	SAW1	YAL027W	786 nt		4.01	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	MTR2	YKL186C	555 nt		4.01	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	USB1	YLR132C	873 nt		4.01	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	FOL3	YMR113W	1284 nt		4.01	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	RAD14	YMR201C	1116 nt		4.01	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YNR071C	YNR071C	1029 nt		4.01	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	MCM16	YPR046W	546 nt		4.01	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	PUB1	YNL016W	1362 nt		4.01	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	RSC1	YGR056W	2787 nt		4	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	FLO10	YKR102W	3510 nt		4	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YIP3	YNL044W	531 nt		4	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YNL171C	YNL171C	369 nt		4	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	RRG9	YNL213C	645 nt		4	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YOL118C	YOL118C	309 nt		4	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	snR17a	snR17a	333 nt		4	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	OXR1	YPL196W	822 nt		4	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	ARA1	YBR149W	1035 nt		4	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	RPN4	YDL020C	1596 nt		4	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	HEF3	YNL014W	3135 nt		4	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	MNR2	YKL064W	2910 nt		4	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	ZDS1	YMR273C	2748 nt		4	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	APE2	YKL157W	2859 nt		4	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	PMT6	YGR199W	2280 nt		3.99	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	SSM4	YIL030C	3960 nt		3.99	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	ARG3	YJL088W	1017 nt		3.99	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	HYM1	YKL189W	1200 nt		3.99	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YML053C	YML053C	639 nt		3.99	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	TIR2	YOR010C	756 nt		3.99	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YOR022C	YOR022C	2148 nt		3.99	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	HSH49	YOR319W	642 nt		3.99	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	HUT1	YPL244C	1020 nt		3.99	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	RNR1	YER070W	2667 nt		3.99	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	RAD2	YGR258C	3096 nt		3.99	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	KAR1	YNL188W	1302 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	APL4	YPR029C	2499 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	ELM1	YKL048C	1923 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YCR016W	YCR016W	873 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	BUD26	YDR241W	288 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	ISC10	YER180C	804 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	PDX1	YGR193C	1233 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	RSM25	YIL093C	795 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	HOT13	YKL084W	351 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	ECM4	YKR076W	1113 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	RPL22A	YLR061W	366 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YLR444C	YLR444C	303 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	ARG80	YMR042W	534 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YOL038C-A	YOL038C-A	96 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	IDH2	YOR136W	1110 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YOR186W	YOR186W	435 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	USV1	YPL230W	1176 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YPR074W-A	YPR074W-A	171 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	HPA2	YPR193C	471 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YBR089W	YBR089W	600 nt		3.98	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	GSC2	YGR032W	5688 nt		3.97	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	ISW2	YOR304W	3363 nt		3.97	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	HCA4	YJL033W	2313 nt		3.97	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	RPL35B	YDL136W	363 nt		3.97	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	PHM6	YDR281C	315 nt		3.97	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YDR526C	YDR526C	471 nt		3.97	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	HAT2	YEL056W	1206 nt		3.97	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YHI9	YHR029C	885 nt		3.97	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YJR071W	YJR071W	369 nt		3.97	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	RIM11	YMR139W	1113 nt		3.97	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	REB1	YBR049C	2433 nt		3.97	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	TRM12	YML005W	1389 nt		3.97	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	TPD3	YAL016W	1908 nt		3.97	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	MDN1	YLR106C	14733 nt		3.96	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	PRP3	YDR473C	1410 nt		3.96	□□□□□ -1.77
MRD1	Q06106	YOS1	YER074W-A	258 nt		3.96	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	ILV5	YLR355C	1188 nt		3.96	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	MED11	YMR112C	396 nt		3.96	□□□□□ -1.78
MRD1	Q06106	MRP2	YPR166C	348 nt		3.96	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms