Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
TNP2Q05952 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms