Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC18A2Q05940 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC18A2Q05940 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC18A2Q05940 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms