Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CALD1Q05682 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CALD1Q05682 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms