Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT17Q04695 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT17Q04695 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms