Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TGFBR3Q03167 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR3Q03167 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms