Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A3Q01959 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC6A3Q01959 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms