Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAP1Q01518 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAP1Q01518 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms