Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNA1BQ00975 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNA1BQ00975 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms