Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2BQ00403 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2BQ00403 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms